找到调控莲雾成熟发育最重要基因-米乐体育官方下载

本报讯(记者张晴丹)近日,海南大学莲雾研究团队以黑糖芭比莲雾作为研究品种,使用长读长测序技术对二倍体莲雾基因组进行组装,得到676.1兆碱基的莲雾基因组,共11条染色体,并揭示出莲雾果实成熟发育最重要的调控基因。相关论文发表于《园艺研究》。

莲雾又名水蓊果,属桃金娘科蒲桃属热带常绿乔木果树,广泛种植于我国广西、海南、广东、云南、台湾等地。莲雾果实口感脆嫩、味道清甜、水分充足、热量低、富含膳食纤维,具有较高的营养价值。作为新兴的热带水果,莲雾因栽培历史较短、分布局限性,导致相关基础研究较为落后。栽培莲雾基因组序列及相关遗传研究的缺乏,严重阻碍了莲雾的育种进程。

研究人员通过系统发育分析发现,莲雾与近缘物种丁香的分离时间大约在1500万年前。通过核型分析发现,莲雾祖先在6500万年前经历了桃金娘科共有的全基因组多倍化事件。

研究团队选取不同发育阶段的莲雾果实及其各种器官中的转录组材料,包括20天时的小果、40天时的小果、60天时的中果、75天时的中果、95天时的大果、110天时的大果,以及120天时的成熟果、功能性叶片、花朵和茎,并对这些材料进行转录组测序。

通过时间趋势分析,他们发现了与莲雾果实发育成熟趋势一致的关键基因模块,得到权重占比最重的3个nac转录因子,并通过结合共表达网络、热图绘制、进化分析,进一步确证这3个nac转录因子是莲雾果实成熟发育最重要的调控基因。

专家认为,该研究为莲雾的遗传研究和基因挖掘奠定了基础,开启了莲雾分子育种的新征程。

相关论文信息:

https://doi.org/10.1093/hr/uhae025


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