美国华盛顿大学圣路易斯分校benjamin d. humphreys团队利用转录组学、表观基因组学和空间代谢组学细胞剖析，揭示了人类肾脏的区域解剖结构。相关论文近日发表于《细胞-代谢》。
研究人员采用高通量单细胞atac/rna测序（share-seq）和空间分辨代谢组学方法，对来自不同肾脏解剖区域的54份人体样本进行了分析。研究人员生成了446267个细胞的转录组图谱和401875个细胞的染色质可及性图谱，并开发了一个软件包分析408218个空间解析代谢组。
研究发现，同一类型的细胞会因解剖位置的不同而显示出不同的转录组、染色质可及性和代谢组特征。对代谢相关基因图谱的研究表明，肾小管节段之间的代谢特征并不重叠，患者来源的近端肾小管细胞脂质代谢紊乱。
将多模态全息图学与临床数据相结合，研究人员发现plekha1是一种疾病标志物，体外敲除plekha1可增加近端肾小管分化过程中的基因表达，表明plekha1可能具有致病作用。
这项研究揭示了之前未知的以人类肾脏解剖学为基础的细胞异质性。
相关论文信息：
https://doi.org/10.1016/j.cmet.2024.02.015